萨摩耶犬起源的故事与古老的萨摩耶人的发展史是密不可分的。故事开始于伊朗高原，部落的人们发现这里虽然寒冷，但冰天雪地的天然屏障却让他们感到很安全，于是他们决定在这里居住下来，开始了与世隔绝的新生活‘这些人就是萨摩耶人。而萨摩耶犬的主要工作就是帮助族人们放牧驯鹿、拉雪橇，同时也是人们不可缺少的好伴侣。

早期在部落里这些狗狗被称为：Bjelkier。后来随着欧洲大国对于探险活动的热衷，接触到了这片荒蛮的土地。探险家把各部落的人们普遍称为“Samoyeds”，所以这个名字就自然而然地成为了萨摩耶犬流传至今的名字。“萨摩耶”这几个字，在西伯利亚语言中的意思是“自己独立生存”，这也正是萨摩耶人和萨摩耶犬的生存之道。

从17世纪至今，萨摩耶犬一直保持着纯正的血统。在所有现代犬种中，萨摩耶犬被认为是最接近原始状态的犬种之一，它们没有混杂狼或狐的血统。

经过了遥远的迁徙，一望无垠的西伯利亚，美丽的俄罗斯成为了它们的新家，而它们最终的栖息地——亚马尔半岛（Yamal Peninsula）就在这其中。

萨摩耶和主人们在这里一直过着与世无争的游牧生活，它们每天忠诚地陪伴着主人，看管着驯鹿，直到现代社会发现了它们的踪迹。