真正的波斯猫眼睛有很多种颜色，并不是固定的，例如蓝色、绿色、黄色或者琥珀色的，也有鸳鸯眼，也就是两只眼睛颜色不一样。不过一般来说，纯种的波斯猫两只眼睛的颜色是一样的，并且眼睛颜色越纯、越深的，血统越纯正。

波斯猫眼睛的颜色与它的毛色有关，银灰色毛发的波斯猫眼睛大多是绿色、黄色、琥珀色，鸳鸯眼多见于白色毛发的波斯猫。