边牧蓝眼睛是一种先天遗传性的疾病，这样的边牧普遍存在夜盲等症状，并且往往有发育迟缓、行动力差之类的并发症。大多数的蓝眼睛边牧狗狗都存在夜盲问题，养蓝眼睛的边牧要在狗舍加装照明设备，并且不适宜晚上带出去玩。

边牧狗狗的蓝眼有时不会真的表现出眼睛为蓝色，而是要看它们的瞳孔颜色来分辨。非蓝眼的瞳孔颜色是黄或绿，而蓝眼的瞳孔颜色是红色。蓝眼边牧狗狗的眼睛虽然好看，它们繁殖的后代也不一定有蓝眼睛的情况，为了蓝眼睛边牧狗狗的健康，不建议蓝眼睛边牧狗狗繁殖。