由于红骨猎浣熊犬窝咳是由细菌，病毒感染引起的，因此治疗时一方面要治疗咳嗽等病症，另一方面是要杀灭病原体。在红骨猎浣熊犬窝咳初期，可以给红骨猎浣熊犬喝一些抗病毒口服液。

同时需要注意给红骨猎浣熊犬做好保暖措施，同时必须给房间消毒。如果是红骨猎浣熊犬窝咳后期治疗原则则是：抗病毒，止咳，化痰，防止并发症，增强红骨猎浣熊犬抵抗力。