圣伯纳犬第一次发情一般是在8个月到一岁半之间，但是圣伯纳犬第一次发情不适合交配，否则对圣伯纳犬健康有很大影响，当半年后，圣伯纳犬第二次发情就可以交配了，不过当圣伯纳犬发情时，一定要照顾好母犬，主人可以给狗穿生理裤，防止未经选择的雄性狗错配，影响后代的质量。另外公狗不得外出寻找母狗，否则容易感染疾病或被其他公狗咬伤，因为争夺配偶。

母圣伯纳犬虽然每年可以繁殖两胎，但生育过密，对母犬和仔犬的体质都有影响。根据母圣伯纳犬的年龄和健康状总可掌握两年繁殖三胎或一年一胎比较适宜。超过9岁的母圣伯纳犬一般不宜再繁殖。

雄性圣伯纳犬不应频繁交配，以免影响健康，缩短繁殖寿命。圣伯纳犬交配一天一次，每3-4天应休息一天，偶尔一天内交配两次，应相隔6小时以上，第二天必须休息。