鳄鱼病毒通常起病比较急，重要出现为腹痛、腹泻、恶心、呕吐等病症，还可有发烧和全身高低不适，大便多为水样便。
可以采用阿昔洛韦进行治疗的，有利于症状的好转，同时保持局部的干燥，不吃辛辣刺激性食物。多在一周内好转的。多喝开水有利于症状的好转。
