英短曼基康矮脚猫的基因主要是由“munchkin gene”的常染色体基因决定的，这个基因被称为M基因，是显性基因，这意味着携带这个基因的猫咪都会成为矮脚猫。这种基因会从胎儿时期起开始抑制猫咪的骨骼发育，直到它们长大成年。

曼基康矮脚猫的短腿基因是大自然天然进化形成的，并不是基因缺陷。虽然它们和折耳猫一样，都是通过基因突变形成的产物，但曼基康矮脚猫的基因突变并不会导致先天性的基因缺陷。

此外，这种基因对于猫咪的其他外貌特征影响较小，不会影响猫咪在其他外貌上面的表现。所以，如果你想要一只纯种的矮脚猫，你需要注意它的基因特征，以确保它是由纯种的M基因决定的矮脚猫。